Structura organizatorică includea: comanda regimentului, statul major, patrula comandă şi trei escadrile de aviaţie de vânătoare. Iniţial, regimentul a avut în dotare avioane IAK-11 şi IAK-18, iar începând cu luna mai 1952, au început să intre în serviciu avioanele MiG-15, în scurt timp regimentul devenind operaţional.

La 15.07.1953, Regimentul 206 Av. V.Ta. este dislocat pe aerodromul Ianca, unde îşi desfăşoa ră activitatea până la 01.05.1955. Începând cu această dată iese din compunerea Diviziei 66 Av. Ta. şi trece în subordinea Diviziei 23 Av. Ta. şi se redislocă pe aerodromul Otopeni.

După dislocarea pe acest aerodrom, piloţii regimentului au început să zboare un nou avion de vânătoare (MIG-17 PF Fresco), primul avion de vânătoare din România care a fost dotat cu radar de interceptare.

La 09.08.1958 Regimentul 206 Av.V.Ta. împreună cu Baza 499 Tehnică Aerodrom se dislocă pe aerodromul Borcea, unde funcţionează şi în prezent, şi primeşte în dotare o escadrilă de avioane MiG-19. Din anul 1959 regimentul trece în subordinea Diviziei 15 Av.V.Ta. şi primeşte un nou indicativ - Regimentul 86 Aviaţie Vânătoare.

În anul 1967, în viaţa Regimentului 86 Av.V. are loc o schimbare importantă, intrând în exploatare un avion de vânătoare de ultimă generaţie, cu performanţe deosebite: MiG-21F-13. Astfel, Regimentul 86 Av.V. este dotat integral cu avioane supersonice: două escadrile cu MiG-21F-13 şi o escadrilă cu MiG-19. In 1974, acestea din urmă vor ieşi din exploatare şi vor fi înlocuite de noile avioane MiG-21RFMM.

Aviaţia militară a fost şi ea afectată de lipsa resurselor din perioada anilor ’80 – ’90. Orele de zbor erau din ce în ce mai puţine, iar comandanţii făceau eforturi disperate de a menţine în capacitatea operaţională cerută

La Borcea s-au format mulţi piloţi de excepţie. Deşi condiţiile sociale erau vitrege, “ stagiul la Borcea” a reprezentat şi reprezintă o carte de vizită ce atestă profesionalismul şi competenţa în meseria de pilot de vânătoare.

După 1995 începe restructurarea amplă Forţelor Aeriene Române. Începând cu anul 1997, o escadrilă a început un antrenament intensiv pentru a fi în măsură să desfăşoare misiuni în comun cu forţe NATO. În acest scop, s-a început un program special de antrenare care avea să conducă la obţinerea unui înalt nivel de interoperabilitate şi escadrila de aviaţie vânătoare de bombardament a fost complet înzestrată cu avioane MIG-21 Lancer.

La nici un an de la demararea programului de modernizare, în 1998 escadrilele de la Borcea execută primele exerciţii internaţionale de forţe aeriene, demonstrând abilităţile noului LanceR iar profesionalismul piloţilor români începe să fie recunoscut de lumea întreagă.

Odată cu operaţionalizarea escadrilelor, au loc transformări profunde şi în concepţia de organizare şi funcţionare a unităţilor de aviaţie. După mai multe formule de organizare, în anul 2000 este creată Baza 86 Aeriană, care integrează, pentru prima dată, elementele acţionale, subunităţile de sprijin şi asigurare, sistemele de comandă şi control. “ Borcea”, cum îi spun aviatorii, devine astfel prima unitate de aviaţie din România organizată după model NATO.

Experienţa căpătată în cadrul exerciţiilor internaţionale fac din Baza 86 Aeriană elementul de referinţă pentru perioada următoare. Astfel, an de an, această unitate reprezintă Forţele Aeriene Române în cadrul unor exerciţii internaţionale, a căror complexitate şi angajament sunt tot mai mari.

În 2000, Baza 86 Aeriană paricipă la cel mai mare exerciţiu de forţe aeriene din lume, NATO AIR MEETING – NAM, în Turcia, unde obţine rezultate remarcabile.

An de an, se deruleaza tot mai multe programe de pregătire în comun cu forţe aeriene ale statelor membre NATO.

Cooperarea cu Forţele Aeriene Franceze şi Forţele Aeriene Regale Britanice, prin exerciţiile VOLFAC , Chasseur Accompli, Lone Kite, Lone Cheetah, Lone Foil, aduce un remarcabil plus de experienţă operaţională contingentelor româneşti. Începând cu 2006 şi Forţele Aeriene ale SUA staţionate în Europa – USAFE – încep un program de antrenament comun cu piloţii români.

În anul 2004, ca urmare a desfiinţării Bazei 57 Aeriană, Baza 86 Aeriană Feteşti ia în subordine o escadrilă de elicoptere, precum şi aerodromul militar Mihail Kogălniceanu, întregindu-şi astfel gama de misiuni cu cele de evacuare, căutare şi salvare, transport şi intervenţie umanitară.

În afară de misiunile principale specifice, Baza 86 Aeriană a desfăşurat şi acţiuni CIMIC precum şi intervenţie la dezastre.

În anul 2006, zona municipiului Feteşti a fost grav afectată de inundaţii; timp de două aproape două luni, militari ai unităţii au participat zi şi noapte la salvarea vieţilor şi evacuarea gospodăriilor distruse.

An de an, personalul unităţii contribuie la ajutorarea familiilor defavorizate ce locuiesc in proximitatea bazei. Cu ocazia sărbatorilor religioase, se organizează acţiuni de binefacere pentru copiii proveniţi din aceste familii, iar preotul de garnizoană organizează activităţi educative şi acordă asistenţă religioasă tuturor celor care au nevoie.

Ca recunoaştere a adevăratei valori a unităţii, în 2006 Baza 86 Aeriană Feteşti este nominalizată pentru a fi una din cele două unităţi reprezentative ale Armatei, în cadrul evaluării periodice efectuate de delegaţiile celor cincizeci şi două de state semnatare ale Documentului de la Viena 1999, referitor la măsurile de creştere a încrederii şi securităţii în Europa, sub egida OSCE.

Perspectiva bazei este una deosebită: avionul multirol care urmează a fi achiziţionat va intra în mai întâi în dotare la Borcea, ceea ce presupune un efort deosebit din partea tuturor. Dar cei de aici ştiu asta şi, aşa cum au facut în toţi aceşti 55 de ani, îşi asumă şi această responsabilitate.